我家房子是2000年造,屋面是预制板,现在楼上再装修改造,房间改成卫生间,能承受?

担心的应该是。
如果砌墙材料是石膏板或是轻质砖承重主要看墙体的变动。
至于房间用途；或者房间睡觉时，漏水冲马桶的声音，以及砌墙用的材料：你的房间顶上会不会漏水，应该问题不大，不影响承重