我们有一个质粒，他含有终止密码子，教授要我对其设计引物然后做PCR，并对PCR产物进行双酶切，但我不知道?

而已扩增的目的片段里没有）在你PCR引物上正向和反向序列前各添加一个酶切位点（既然是双酶切那这两个酶应该不一样。pcr后连T载体再酶切回收。同时用同样的酶对你的载体酶切并回收，同时注意移码的问题，再将两者相连。
你说到的去除终止密码子，应该是指的你的目的片段上的，且这两个酶切位点是你要用的载体上也存在的

PCR扩增的是片段，切掉了这个基因就会一直转录下去，要看让你设计什么样子的引物，终止密码子一般是不能切掉的，引物包含双酶切位点这个你要问问你的教授是想干什么用，合成的蛋白就不是以前的蛋白了