准备交房了,在验房的时候发现主卧的净高要比客厅的净高高出5厘米多,这样的房屋符合规定吗?

能这样来看，如“知道君”所说的±20mm的差距！
国家的规范中，是指的同一块板里面。
也就是房屋的顶部；
卧室楼板用的钢筋细些。你一定是卧室的空间高于客厅空间5cm，但是你说的状况是客厅和卧室的顶棚差，被圈梁或者墙壁分隔开的方块里面，所以楼板相应会厚些，所以卧室的楼板会薄些，任意两点的差距不能超过±20mm，是分属两个不同的版块来认定的！
一般来说客厅的跨度大一些，楼板里面用的钢筋会粗些，这是正常的

允许偏差值、允许极差值±20mm、净进深均匀20mm。 2，即不能超过40mm 1：净高±20mm：净高及净开间，净开间、净进深±15mm