乙方租了甲方的房子，不在合同内写明“可以转让”等字眼。而是写：主权归甲方所有，合同期内使用权归乙方?

无需特意在说明，所有权本身即归甲方，及转租后的利益归属等租房合同，可以约定有转租权或没有转租权，乙方有使用权

主权只有国家才有：承租人在租赁期间未经出租人同意，不得转租！根据 我国合同法相关规定！
但以那个“主权”表述不点不妥这是可以，你可以写，否则出租人可以解除合同

转租是必须明确约定，或者取得房主的同意
转租后，责任仍然由你承担
你可以表述成，合同期内使用权由乙方享有，使用方式由乙方决定，由此造成的房屋损失及产生的孳息均由乙方承受，乙方负支付租金及法律规定的修缮义务。
罗里吧嗦，不要介意，为了掩盖一些东西而已。
或者你不怕业主反对，直接表述成有转租的权利就可以了。。。想来他是反对的

”主权归甲方所有，合同期内 使用权归乙方“，只能表示乙方能够使用房屋，不能当然地认定乙方可以转租，更不存在可以转让一说。

只在合同中明确约定，承租方有没有转租权即可，如果有转租权，约定是经过出租房的书面同意或者是其他方式同意。

法律规定没有经过出租人同意，承租人不可以擅自转租，否则，由此造成的损失由承租人赔偿。你这个约定是不是说所有权归甲方，使用权归乙方？这个说的是大实话。